Jacques van Oortmerssen studierte am Konservatorium zu Rotterdam Orgel bei André Verwoerd und Klavier bei Elly Salomé. Er setzte sein Orgelstudium bei Marie-Claire Alain in Paris fort und erhielt 1976 den Prix d'Excellence. Jacques van Oortmerssen ist seit 1979 Professor für Orgel am Sweelinck Konservatorium in Amsterdam. Er ist der Nachfolger von Gustav Leonhardt als Organiste Titulaire an der Waalse Kerk in Amsterdam und gibt jährlich zahllose Konzerte in der ganzen Welt und mehr und mehr auch als Dirigent.